Ao deflagrar-se a Guerra da Tríplice Alian?a, o 9o Batalh?o segue para o teatro de opera??es, integrando a 9a Brigada de Infantaria. Permaneceu no teatro de opera??es por cinco anos, participando de inúmeros combates onde sempre foi destaque. Na Batalha Naval de Riachuelo, combateu como tropa embarcada. Prosseguiu combatendo em: Potrero Obella, Tayi, Estero Bellaco, Piquiciri Avai onde tombou seu comandante, o Tenente-Coronel Francisco de Lima e Silva, atual Patrono do 62o Batalh?o de Infantaria, de Joinvile. Assume, ent?o, o comando do Batalh?o o Major Floriano Vieira Peixoto, futuro Presidente da República. Sob este comando, o 9o Batalh?o participou dos combates de Lomas Valentinas, Itá-ibaté, Angostura, Peribebui, Campo Grande e por fim esteve presente em Cerro Corá, onde tombou o Marechal Francisco Solano Lopes, Presidente do Paraguai, dando fim a guerra.

O 9o Batalh?o, retorna ao Brasil, em 1870, tendo como destino Recife. Agora com a denomina??o de Batalh?o de Infantaria Ligeira. Permanece na guarni??o até 1888, quando é transferido para Salvador, na Baía, com a denomina??o de 9o Batalh?o de Infantaria (Dec 10.015, de 18 de agosto de 1888).

é este 9o Batalh?o de Infantaria que, nos idos de 1896-1897, participou ativamente de todas opera??es contra a Insurrei??o de Canudos, no sert?o baiano. Uma sua Companhia, sob o comando do Tenente Manoel da Silva Pires Ferreira constituiu a 1a Expedi??o, travando encarni?ado combate corpo-a-corpo com os jagun?os, em Uauá, em 21 de novembro de 1896. Contribuiu com a maioria do efetivo da 2 aExpedi??o, sob o comando do Major Febr?nio de Brito. Eram ao todo 500 homens armados de Camblain e Manlinchen, mais dois canh?es Krupp e duas metralhadoras Nordenfeldt, que enfrentaram os insurretos no combate de Mulungu, por cinco horas, e no dia seguinte foram levados a enfrentar cerca de 4.000 jagun?os dos quais 800 ficaram no campo de batalha.